侯婉婷 1,2 , 唐秋琳 2 , 毕锋 1,2
  • 1. 四川大学华西医院 肿瘤中心 腹部肿瘤科(成都 610041);
  • 2. 四川大学华西医院 肿瘤分子靶向治疗实验室(成都 610041);
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本文旨在通过大样本基因组学分析技术,评估 lncRNA、miRNA、mRNA 及 ceRNA 在肾透明细胞癌中的差异表达情况及其预后价值。利用 R 软件对 TCGA 数据库中肾透明细胞癌 RNA 和 miRNA 数据进行基因差异表达分析和生存分析,并通过 cytoscape 软件得到差异表达的 lncRNA-miRNA-mRNA 之间的 ceRNA 调控关系网。结果发现共有 1 570 个 lncRNA、54 个 miRNA 和 17 个 mRNA 在肾透明细胞癌组织中存在异常表达,且其表达水平以上调为主(错误发现率 < 0.01;对数差异表达倍数变化绝对值 > 2)。ceRNA 调控网显示共 89 个差异表达的 lncRNA 和 9 个差异表达的 miRNA 之间存在相互作用关系,生存分析共鉴定出 COL18A1-AS1、TCL6、LINC00475、UCA1、WT1-AS、HOTTIP、PVT1 等 38 个有预后价值的 lncRNA 和 2 个有预后价值的 miRNA(miR-21 和 miR-155)(P < 0.05)。本研究将为肾透明细胞癌靶向治疗与预后评估提供新的理论依据。

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