• 宝鸡文理学院 物理与光电技术学院, 宝鸡 721016;
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基因调控网络的重构可以挖掘出基因之间潜在的调控作用关系,帮助我们更深刻地理解复杂的调控机制,在系统生物学中,这已经成为人们研究的一个热点问题。现在已经产生了大量推断网络构建的模拟理论和计算方法,其中一些信息论方法在计算中容易遗漏一些调控关系,这些调控关系可能代表基因间真实的调控关系。为了克服这个缺点和进一步提高网络重构的精度,本文提出了一种新的基因调控网络构建方法,它通过重采样和加权平均策略,利用条件互信息来进行基因调控网络重构。算法首先从基因表达数据中重采样得到一系列子数据,然后通过条件互信息方法构建一系列子数据的网络,最后利用这些子网络加权平均得到最终的基因调控网络。本文的算法在DREAM3模拟数据和SOS真实网络数据上进行验证,和其它一些流行的方法相比,本文提出的网络重构算法取得了较高的精确度和准确度。

引用本文: 刘飞. 重采样条件互信息构建基因调控网络算法研究. 生物医学工程学杂志, 2016, 33(5): 985-990. doi: 10.7507/1001-5515.20160158 复制

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